Mighty Joe Young

En 1949 O'Brien realizó su última película como director de efectos especiales: Mighty Joe Young, considerada por algunos como la mejor película de O'Brien a nivel animación y ganadora del Oscar a los mejores efectos especiales.

Esta película la realizó O'Brien con la ayuda de su discípulo.

O'Brien creó más proyectos como Emilio and Guloso, sobre un niño mexicano que tiene que salvar su pueblo del ataque de un dinosaurio, un remake de King Kong en Cinerama, y hasta King Kong vs. Frankenstein, cuyo guión se recicló para la película japonesa King Kong vs. Godzilla, pero no consiguió venderlos, acabó en el cine de serie B participando en películas como The Animal World (1956), The Black Scorpion (1958) y Behemoth the Sea Monster (1959)